このポータルは国際コンソーシアム Pathogen Data Network の一環として日本DNAデータバンク (DDBJ)が運営しています。 ウェブサイトはスウェーデンの SciLifeLab Data Centre が公開する情報を基礎に GitHub および Hugo を用いて作成し、MITライセンスで公開しています。

• 2020年10月 COVID-19データポータル (COVID-19 Data Portal Japan) を国立情報学研究所の RCOS (オープンサイエンス基盤センター) が開始
• 2025年06月 DDBJが上記ポータルの運営を正式に引き継ぎ